139 편의 논문
이 연구는 알츠하이머병 환자의 전두엽 피질에서 전사체, 단백질체, 대사체 데이터를 통합하여 TCA 회로 및 산화적 인산화 등 에너지 생성 경로의 하향 조절이 효소 양 감소와 억제적 알로스테릭 효과에 의해 주도됨을 규명함으로써 알츠하이머병의 대사적 조절 교란과 에너지 결핍 메커니즘을 체계적으로 제시했습니다.
이 논문은 체외 실험 데이터로 학습된 대규모 인과적 세포 모델 'TwinCell'을 통해 질병과 건강 상태 간의 전환을 주도하는 상류 조절 인자를 식별하고, 이를 다양한 치료 영역에서 임상적으로 검증된 표적과 기작을 재현하는 데 성공하여 신약 개발의 전임상에서 임상으로의 간극을 해소함을 보여줍니다.
이 논문은 MoTrPAC 컨소시엄의 연구를 통해 인간 골격근이 지구력 운동과 저항성 운동에 반응할 때 전사체와 단백질체 변화보다 먼저 ATAC-seq, 인산화 프로테옴, 대사체 변화가 발생하며, MEF2A 및 NFIC 조절을 통한 공통 경로와 운동 유형별 고유한 분자 서명이 시계열적으로 조절됨을 규명했습니다.
이 연구는 간 시계 조절을 받아 순환하는 니코틴산 리보사이드 (NaR) 가 프레포딘 복합체를 통해 단백질 항상성과 CEBPA 발현을 조절함으로써 지방세포 분화와 지질 침착을 시간 의존적으로 조절한다는 새로운 기전을 규명했습니다.
이 논문은 신경망과 게놈 규모 동적 플럭스 균형 분석 (dFBA) 을 결합한 하이브리드 모델인 dAMN 을 제시하여, 다양한 영양 환경에서 박테리아의 성장 곡선과 기질 고갈 역학을 높은 정확도로 예측하고 표준 dFBA 모델에 없던 지연기 (lag phase) 적응 역학을 구현할 수 있음을 보여줍니다.
이 논문은 MoTrPAC 연구의 초기 결과를 통해 건강한 성인을 대상으로 한 격렬한 유산소 및 근력 운동이 급성 및 만성적으로 생리적, 대사적 변화를 유발하며 두 운동 방식이 뚜렷하게 다른 적응 반응을 보임을 밝혔습니다.
이 논문은 신경 사후 추정 (Neural Posterior Estimation) 기법을 활용하여 우도 함수가 계산 불가능한 세포 이동 스토캐스틱 모델의 매개변수를 요약 통계량이나 원시 공간 데이터로부터 직접 추론하고, 기존 근사 베이지안 계산 방법의 한계를 극복하여 생물학적 해석 가능한 매개변수를 정확하게 복원하는 프레임워크를 제시합니다.
이 연구는 다양한 오믹스 및 다형질 분석을 통합하여 대사기능부전 관련 지방간질환 (MASLD) 의 진행에 관여하는 39 개의 후보 유전자를 식별하고, 단일핵 RNA 시퀀싱 및 실험적 검증을 통해 MLIP 와 같은 유전자의 역할을 규명함으로써 새로운 치료 표적과 연구 자원을 제공했습니다.
이 연구는 13C-라이신 대사 표지법을 활용하여 노화가 신장 기질 단백질의 분해 능력을 저하시키고 구조적 변화를 유발하여 신장 섬유화를 초래한다는 기전을 규명했습니다.
이 연구는 단일 세포 전사체 데이터를 기반으로 한 세 가지 계산 프레임워크를 비교 분석하여, 뇌종양 미세환경에서 대사적 우위를 점하는 종양 연관 대식세포의 대사 특성을 규명하고 이를 새로운 치료 표적으로 제시합니다.
이 논문은 불린 네트워크 제어 도구의 예측 불일치 원인을 규명하기 위해 제어 문제의 분류 체계를 제안하고, 이를 기반으로 여러 도구의 결과를 통합하여 표적 돌연변이를 우선순위화하는 새로운 메트릭을 개발했습니다.
이 연구는 Hi-DFA 플랫폼을 활용하여 스트레스를 겪은 세균이 항생제 노출 시 일시적인 내성 상태를 형성하여 생존하고 재성장하는 새로운 메커니즘을 규명함으로써, 항생제 투여 전략 최적화에 중요한 통찰을 제공했습니다.
이 논문은 TGFβ 신호 전달 시스템에서 핵심 수용체가 리간드 경쟁을 통해 신호를 억제하는 경향이 더 강하며, 세포가 단일 유전자를 통해 이러한 핵심 수용체의 발현을 조절함으로써 활성 리간드 - 수용체 환경을 전환할 수 있음을 규명했습니다.
이 논문은 유동 - 관성 기반의 '일반형성 이론 (GMT)'을 제안하여, 분자 수준에서 생물체 수준에 이르기까지 다양한 스케일의 소산 구조 동역학을 통합적으로 설명하고 12 가지의 보편적 설계 패턴을 규명했습니다.
이 논문은 단일 샘플 네트워크 추론 방법들의 수학적 기반을 통합하여 재해석함으로써, 공유된 에지와 샘플 특이적 에지 예측 간의 트레이드오프를 규명하고 향후 공통 프레임워크 개발을 위한 방법론적 시너지를 제시합니다.
이 논문은 AOP-Wiki 기반의 AOP 네트워크를 다양한 생물학적 도메인 정보와 통합하여 동적 필터링, 다중 쿼리, 그리고 시스템 수준의 분석을 가능하게 하는 대화형 그래프 기반 플랫폼 'AOPGraphExplorer 2.0'을 소개합니다.
이 연구는 효모 노화 모델을 기반으로 한 대규모 로봇 자동화 및 머신러닝 기법을 활용하여 노화 과정에서 단백질의 공간적 재배치와 농도 변화를 체계적으로 규명하고, 단백질 구조적 특성이 노화 민감성을 결정하는 핵심 원리임을 규명했습니다.
이 논문은 효모의 노화 과정에서 단일 세포 공간 프로테오믹스 분석을 통해 노화의 주요 특징들 간의 분자적 상호연결성을 규명하고, 핵소체 기능 장애, 프로테오스타시스 감소, 미토콘드리아 기능 부전 등이 다른 노화 징후에 선행하는 위계적 실패 순서를 제시합니다.
이 연구는 전자담배 노출로 인한 염증 및 응고 이상을 고용량 비타민 D 보충이 완화하고 니코틴 의존성을 낮출 수 있음을 시사합니다.
본 연구는 심장 이식 환자의 나이가 증가할수록 이식편 거부 반응 위험이 감소하며, 이는 노화 관련 면역 세포 변화와 만성 염증 경로와 연관되어 있음을 규명하여 노령 이식 환자에 대한 맞춤형 면역억제 전략의 필요성을 시사합니다.